تشمل الأمانة العامة التي يلحق بها مكتب التنظيم العام ومكتب الأمن الداخلي المديريات الفرعية التالية:

1- المديرية الفرعية للمستخدمين والتكوين.

2- المديرية الفرعية للمالية و المحاسبة

3- المديرية الفرعية للوسائل و الصيانة.

4- المديرية الفرعية للأنشطة العلمية و الثقافية و الرياضية

5- المصالح المشتركة

المديرية الفرعية للمستخدمين والتكوين: وهي مسؤولة عن

تسيير الموظفين الإداريين على مستوى رئاسة الجامعة والمصالح المشتركة الذين تم تعيينهم من طرف رئيس الجامعة

وضع  نظام وتنفيذه للتكوين وتحسين المستوى للموظفين الإداريين والتقنيين لخدمة الجامعة

تسيير المستخدمين وتوزيعهم  توزيعا متوازنا بين الكليات والأقسام وحسب الاحتياجات

تنظيم وتنسيق وتنفيذ خطط لإدارة الموارد البشرية بالجامعة

وتشمل المديرية على المصالح التالية

  1. مصلحة المستخدمين الأساتذة
  2. مصلحة الموظفين الإداريين والتقنيين وعمال الخدمة
  3. مصلحة التكوين  وتحسين المستوى

المديرية الفرعية للمالية والمحاسبة: وهي مسؤولة عن

  • إعداد مشروع الميزانية للجامعة  على أساس المقترحات المقدمة من طرف عمداء الجامعة  ومدراء المعاهد
  • متابعة تنفيذ وتسيير ميزانية الجامعة
  • إعداد  إعتمادات عمداء الكليات ومدراء المعاهد  وضمان مراقبة تنفيذها
  • متابعة تمويل الأنشطة البحثية وضمانها لمخابر البحث
  • متابعة يومية لحسابات الجامعة

وتشمل المديرية على المصالح التالية

  1. مصلحة الميزانية والمحاسبة
  2. مصلحة المالية والبحث العلمي
  3. مصلحة المراقبة وتسيير الصفقات

المديرية الفرعية للوسائل والصيانة: وهي مسؤولة عن

  • القدرة الذاتية للتشغيل المحكم لوسائل رئاسة الجامعة والمصالح المشتركة
  • ضمان الصيانة والحفاظ على الممتلكات المنقولة وغير المنقولة لرئاسة الجامعةوالخدمات المشتركة
  • الاحتفاظ بسجلات الجرد
  • ضمان حفظ وصيانة أرشيف الجامعة
  • ضمان تسيير حظيرة السيارات لرئاسة الجامعة

وتشمل المديرية على المصالح التالية

  1. مصلحة الوسائل والجرد
  2. مصلحة الصيانة
  3. مصلحة الأرشيف

المديرية الفرعية للنشاطات الثقافية والرياضية: وهي مسؤولة عن

- تعزيز وتطوير الأنشطة العلمية والثقافية داخل الجامعة للطلبة

- دعم الأنشطة الرياضية في إطار الرياضة الجامعية

- تنفيذ الأنشطة الترفيهية

- القيام بأنشطة التوعية لصالح موظفي الجامعة

وتشمل المديرية على المصالح التالية

  1. - مصلحة النشاطات  العلمية والثقافية
  2. - مصلحة النشاطات الرياضية  والترفيهية